Podemos considerar a diarréia uma maneira que o organismo encontra para eliminar algo que o esteja agredindo. Isso se dá por meio de fezes de consistência alterada, com odor e coloração alterados de acordo com o conteúdo e com o agente envolvido.

A Escherichia coli e a Salmonella sp. são transmitidas através de água, alimentos e fezes de animais contaminados. As enterites baterianas causam alta mortalidade entre os filhotes e deixam as fezes com odor fétido, com presença de sangue. No caso da E. coli, as fezes ficam escuras, e no caso de Salmonella, tornam-se claras. A E. coli pode provocar ainda um comprometimento do sistema reprodutivo da ave, num quadro chamado salpingite.

O tratamento das enterites bacterianas envolve tratamento com antibióticos específicos, limpeza e desinfecção de todas as instalações e utensílios que tiveram contato com a ave infectada.

Isospora sp. e Eimeria sp. são os principais agentes das enterites provocadas por protozoários. Essas são as chamadas coccidioses, que causam uma diarréia de consistência mucosa que leva a uma rápida desidratação e diminuição de apetite.

O tratamento é feito com higienização e medicamentos próprios chamados coccidicidas.

As enterites provocadas por parasitos causam fezes aquosas com restos de alimento. Esses vermes atacam o sistema digestivo e devem ser identificados o mais breve possível por meio de exames parasitológicos completos, sendo combatidos com medicamentos adequados.

Animais debilitados e desnutridos são os mais suscetíveis a sofrerem ação de vírus, que são altamente contagiosos e de difícil erradicação. Isso explica a alta mortalidade nos casos de enterites viróticas. O tratamento é feito pela aplicação de antibióticos e complexo vitamínico de suporte.